HomeSaluteBiotecnologie e GeneticaCome la genetica del lupus si interseca con COVID-19

Come la genetica del lupus si interseca con COVID-19

(Lupus e COVID-Immagine-Credito di immagine: vchal/Shutterstock).

Il lupus può causare cambiamenti genetici che supportano l’attivazione della via dell’interferone di tipo I (IFN). Ma la ragione per cui le persone continuano ad avere un’alta frequenza di alleli di rischio associati al lupus nel sistema immunitario rimane poco conosciuta. Timothy B. Niewold del Colton Center for Autoimmunity presso la NYU Grossman School of Medicine e colleghi hanno ipotizzato che la continua presenza di alleli di rischio di malattia autoimmune della via IFN sia dovuta al fatto che svolgono un ruolo protettivo contro l’infezione virale.

La pandemia di COVID-19 ha offerto un’opportunità senza precedenti per testare questa teoria.

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L’attivazione del percorso I IFN ha aggiunto una maggiore protezione dalla mortalità da COVID-19. Per le persone di origine europea-americana, i ricercatori hanno trovato un aplotipo del fattore di regolazione dell’interferone 5 (IRF5) e alleli della proteina chinasi I cGMP-dipendente (PRKGI) collegati al rischio di morte per COVID-19. “Questi dati supportano l’idea che gli alleli di rischio del percorso dell’IFN di tipo I per le malattie autoimmuni possano persistere in alta frequenza nelle moderne popolazioni umane a causa di un beneficio nella nostra difesa contro le infezioni virali”, ha concluso il team di ricerca.

Lo studio “Interferon pathway lupus risk alleles modulate risk of death from acute COVID-19” è stato recentemente pubblicato sul server preprint medRxiv *.

Risultati della ricerca Lupus e COVID

Il team di ricerca ha creato diversi modelli di previsione multivariati che combinano la genetica e altri biomarcatori per prevedere il rischio di mortalità di una persona se fosse stata infettata da COVID-19. Hanno esaminato l’ascendenza genetica di 756 europei-americani e 398 afroamericani che sono stati ricoverati in ospedale per malattia acuta da COVID-19. I loro risultati hanno registrato molteplici associazioni tra i polimorfismi funzionali dell’associazione lupus nella via dell’IFN di tipo I e la mortalità da COVID-19.

I ricercatori confermano il ruolo fondamentale svolto dall’IFN di tipo I nella prevenzione dell’infezione da COVID-19. Mutazioni genetiche come alleli con perdita di funzione e alleli con guadagno di funzione nel percorso di tipo I hanno influenzato la difesa virale e hanno fornito esiti diversi alla mortalità da COVID-19.

Gli alleli genetici nella discendenza europea-americana aumentano il rischio di mortalità

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La presenza di aplotipi IRF5 aumenta il rischio di lupus. In questo studio, le persone di discendenza europea-americana hanno mostrato che uno specifico aplotipo di IRF5 era associato a un IFN sierico inferiore e a un aumento del rischio di mortalità per COVID-19.

Avere gli alleli PRKG1 ha anche aumentato il rischio di mortalità negli europei-americani. Inoltre, i giovani avevano maggiori probabilità di avere questi alleli genetici poiché il loro rischio di mortalità superava il 25% rispetto a meno del 5% dei decessi nella fascia di età 45-54.

I partecipanti europei-americani più giovani a cui mancavano i genotipi di rischio non sono morti a causa dell’infezione da COVID-19.

Grafico di correlazione tra rapporto IFN di tipo I per genotipo e odds ratio per mortalità correlata a COVID-19 acuto per lo stesso genotipo. I rapporti di IFN sono calcolati dai nostri precedenti studi pubblicati su SLE annotati nella sezione Metodi, calcolando un rapporto dei valori medi di IFN circolanti tra i gruppi di genotipi. Le categorie di genotipi utilizzate sono le stesse sia per l'analisi IFN che per l'analisi di mortalità COVID-19. La confidenza del 95% è mostrata con l'ombreggiatura blu. TCTA indica il trasporto dell'aplotipo di rischio associato a IRF5 COVID-19.

Grafico di correlazione tra rapporto IFN di tipo I per genotipo e odds ratio per mortalità correlata a COVID-19 acuto per lo stesso genotipo. I rapporti di IFN sono calcolati dai nostri precedenti studi pubblicati su SLE annotati nella sezione Metodi, calcolando un rapporto dei valori medi di IFN circolanti tra i gruppi di genotipi. Le categorie di genotipi utilizzate sono le stesse sia per l’analisi IFN che per l’analisi di mortalità COVID-19. La confidenza del 95% è mostrata con l’ombreggiatura blu. TCTA indica il trasporto dell’aplotipo di rischio associato a IRF5 COVID-19.

Gli alleli genetici nella discendenza afroamericana modulano il rischio duìi Lupus e COVI

Le persone di origine afroamericana infettate da COVID-19 avevano varianti genetiche nei geni IRF7 e IRF8 associate alla mortalità.

In particolare, l’allele G del gene IRF7 SNP rs702966 è stato collegato a un aumento della mortalità ed è anche associato a una diminuzione della risposta all’IFN di tipo I nei pazienti con lupus. Il polimorfismo a singolo nucleotide rs4963128 nel gene adiacente PHRF1 è stato anche collegato a cambiamenti nei livelli di IFN di tipo I nel lupus e ha rappresentato le differenze nella mortalità nell’infezione virale. “Sembra probabile che l’SNP PHRF1 possa etichettare un elemento genetico funzionale che modula il gene IRF7 adiacente per influenzare l’IFN di tipo I, poiché si pensa che PHRF1 non funzioni nel percorso dell’IFN di tipo I”, hanno spiegato i ricercatori.

Avere gli alleli IRF7 ha avuto un effetto più significativo sulla mortalità tra i pazienti afroamericani più anziani. Al contrario, gli alleli di rischio associati al lupus nel gene IRF8 erano collegati a una maggiore protezione dalla mortalità per COVID-19 negli afroamericanil ma non negli europei americani.

Limiti dello studio

Il pool di partecipanti allo studio potrebbe aver influenzato i risultati dello studio. Durante l’ondata di pandemia di COVID-19 a New York City (NYC) nel 2020, i ricercatori hanno arruolato con successo un ampio gruppo di persone per lo studio. Tuttavia, poiché i casi di COVID-19 di New York sono diminuiti e sono rimasti bassi, è stato difficile replicare una coorte simile.

*Avviso IMPORTANTE

medRxiv pubblica rapporti scientifici preliminari che non sono sottoposti a revisione paritaria e, pertanto, non devono essere considerati conclusivi.

Fonte: medRxiv *.

 

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